Пакетная перекодировка группы файлов
Отлично показала себя бесплатная программа UTFCast Express.
Она позволяет легко и быстро в автоматическом режиме перекодировать каталог и все файлы в подкаталогах в пакетном режиме.
В последней версии (1.0.5.22 от 2014 года) есть перекодировка без BOM.
Важная особенность: программа только умеет сохранять исходные файлы в новой кодировке в другой папке, заменять текущие файлы она не умеет. Также, новую папку, в которую программа положит выходные файлы, необходимо создать заранее.
Исходную кодировку и тип файла программа определяет автоматически.
также программа работает на Windows 10, хотя её поддержка и не заявлена.
Перекодировка отдельных файлов вручную
Два наиболее удобных редактора - Notepad++ (NPP) и AkelPad справляются с этим.
Notepad++ (NPP) не имеет рекурсивной простой и удобной перекодировки нет, но можно легко убирать BOM. Перекодировка между разными форматами происходит через меню. Возможна обратная перекодировка из UTF8 в Windows 1251 (ASCII).
AkelPad может вручную сохранять в UTF-8 без BOM через стандартное меню Save as.
Имейте ввиду, что если вы перекодируете .htaccess файл или PHP, то обязательно сохранять без BOM, иначе файлы не смогут исполниться.